Náklady do zakázek nevstupují ze zálohových faktur a vyúčtování zálohy. Přenesení nákladů je potřeba provést až ze soupisu konečné faktury, kde je potřeba uvést řádek v kladné výši základu dph fakturované částky s uvedením čísla zakázky, číslo zakázky nelze zapisovat do řádku odpočtu faktury.