Možnost využití skonta u faktur je třeba mít nastaveno. Toto se nastavuje v přímo v nastavení fakturace: Fakturace - Obsluha - Nastavení - Implicitní nastavení - záložka Dodavatelské - Skonto FP. Faktura přijatá, která má označení Skonta se automaticky chová tak, že rozdílná částka faktury a úhrady se automaticky bere celá jako skonto.