V případě, že je využívána autorizace je zde uplatněn stejný princip jako při platbě faktury – není možno ji vybrat pro úhradu (zápočet).
Na vstupní podmínce je možno zatrhnout parametr Zobrazit i neautorizované faktury. Po zatržení tohoto parametru, budou v seznamu přijatých faktur zobrazeny i ty, které ještě nejsou autorizovány. Jedná se o doklady, které spadají do vstupní autorizace. Tyto faktury budou pouze zobrazeny v seznamu a nebude umožněn jejich výběr k provedení zápočtu.
